日本三大禅宗(临济宗、曹洞宗、黄檗宗)之一，本山在京都府宇治市黄檗山万福寺。17世纪中叶，中国明朝僧人隐元隆琦创立。其教义与临济宗相同。受明代念佛禅的影响，用汉语诵读经文。寺号、规制、礼仪皆仿效明朝习俗。前任十三世住持都是中国人，十四世以后中日僧侣交替任住持，二十三世后主持皆为日本人。明治维新时被取缔，曾依附于临济宗，1876年再次独立，一直存在到现在。