其前身为普慈施医院，中国回教协会北京分会创办。新中国成立后，1949年10月北京市回族工作委员会在接受普慈施医院留守人员的同时，在北京宣武区牛街成立新中国第一所回民医院。金雅如任院长。1950年5月改由马务本、马彭年负责。1953年在牛街南口北樱桃园新建院址。回族医师沈成章任院长。至1966年，发展为内、外、儿、妇、眼、口腔、耳鼻喉、中医及放射、理疗、生化、检验等门类齐全的综合性医院。有职工130余名。“文革”期间改称向阳医院。1978年恢复原名后，逐渐增扩，1990年新建12层门诊病房大厦。面积由原来1800平方米增至12000平方米。设病床400床。